Yamaha 在 1993 年首次发布了搭载直列四气缸发动机的中型运动街车 XJR400，以 The Fighting Spirit “ 战斗的精神 ” 之名，加入到当时日本本土市场如火如荼的中量级市场大战中。该车的发动机型式为风冷（带油冷器）四冲程直列四气缸、DOHC 每气缸四气阀的发动机，缸径、行程为 55 mm x 42 mm，排气量 399 cc，气缸组前倾 14 度（气缸组的中心线，与垂直线之间的夹角）的设计，最大马力输出 39 kw（约 53 匹）。车体使用一副钢管式的车架，圆形的前大灯、双圆筒式的仪表板，叉芯口径为 41 mm 的正立式前叉，前双碟制动系统。
1994 年，XJR400 推出了标配 Ohlins 奥林斯后减震的 S 版；1995 年，XJR400 首次推出了标配奥林斯后减震、Brembo 布雷博前刹车卡钳的 R 版，以及在 R 版的基础上换装了方型前大灯、带小型车头整流罩的 RII 版（厂方的材料称、这是 XJR400 的首次重大改变，该车前后共经历了 1995、1998、2001 三次重大变化）。此后，基础型的 XJR400 渐渐退出了市场，剩下更高配置的 R 版继续发售。
从 1993 年首次推出到 2007 年发布最后一次更新，XJR400 都没有推出过换代产品，十五年的产品寿命周期里，该车曾经历过两次的重大更新（4HM 中期型、4HM 后期型）：
1、1998 年五月发布的中期改进型 XJR400R（4HM 中期型），换装了新外形、且有着更大容量（从 18 公升增加至 20 公升）的油箱，新设计的仪表板、车体尾部和中部两侧的外壳、后刹车灯，新的鞍座，发动机外部采用了有着铝合金原色风格的银灰色；
2、2001 年三月推出的、属于最终版的 XJR400R（4HM 后期型），换装了响应特性更佳的新型化油器，轻量化的后轮框，更好性能的配套轮胎，车体重量降低了 3 公斤，新的一体式刹车卡钳，加入有助燃烧、降低排放污染的二次空气导入系统等；
3、从中期型开始，XJR400 就只剩下 R 版供应日本本土市场。
下图是 1993 - 2007 XJR400 各版本的工厂代号：
2002、2003 款的 XJR400R 维持了 2001 款的机械规格，仅是更换了车体的图案/贴花。
2003 年十二月发布了 2004 XJR400R，沿用了此前版本的规格，除了换上新的车体图案/贴花之外，还标配了防盗系统，消声器和对应的点火时间经过调整，降低了噪音以应对新的法规管制、并提高了中低转速域的加速感，仪表板也换成了与旗舰级版本 XJR1300 相同形状的风格。
XJR400R 的最后一次更新发布是在 2007 年一月，不久后正式全面停产。
